参数性质

序号

技术参数与性能指标

1

由于不能事先确定样本总数，以最终实际完成测序样本数量进行结算，预计完成80份样本的宏基因组测序，每份样本/菌株测序价格不超过400元，以实际测序份数进行结算。

2

宏基因组和样本接收：采购人提供原始样品，供应商配备专人负责样品的收集及运输，根据采购人需求实时收取样品，样品均需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。

3

宏基因组和测序平台和策略：均利用二代测序平台，能完成双端PE150测序及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。

4

宏基因组测序质量：碱基质量均达到Q30（99.9%）≥85%；（提供同类项目报告复印件，报告内容包括碱基质量Q30，并加盖供应商鲜章）

5

宏基因组测序数据统计与质控：均需进行原始序列统计，质控后序列统计，去宿主后序列统计，每份样品数据产出统计。

6

宏基因组交付数据：均需包括原始数据（rawdata，数据格式为fastq），质控后数据（cleandata，数据格式为fastq）和拼接后数据（数据格式为fasta）。

7

宏基因组宿主去除：均需将质控后数据（cleandata）与宿主基因组比对去除宿主的序列信息，提供去宿主序列信息后的有效数据。

8

宏基因组质控要求：每批样品收到后应立即开始DNA提取、质量检测等相应工作，使用电泳方法进行核酸样品完整性检测，使用Qubit进行样品浓度检测；DNA提取失败的样品，供应商不收取费用；样品DNA质量检测结果，浓度或总量满足建库条件，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样；上机测序前，对构建好的文库进行质量检测。（提供同类项目报告复印件，报告内容包括样品浓度检测报告和文库质量检测报告，并加盖供应商鲜章）

9

供应商提供核酸提取、文库制备、测序、数据处理的全流程服务。

10

（1）保密要求：供应商应遵守国家法律法规，高度重视安全保密工作，供应商需提供承诺函（提供承诺函原件加盖供应商公章，格式自拟），承诺函内容应包含下述内容：不透露采购人及采购人系统中的数据信息；不得将样本及与样本有关信息转交于第三方及境外组织等。

（2）数据的交付与保存：供应商成交后，需在接收到样本30个工作日内完成该批次所有样本检测与交付。提供每份样本收费明细，以此作为付款凭证。提供3个月样本与核酸保存服务，根据采购人需求，在协商周期内返还剩余样本及核酸；下机数据同时采用移动硬盘和网络下载的方式进行交付，网络下载方式数据下载期限不低于30天；测序下机后的原始数据供应商需保存三年。

（3）项目验收

a.出具专业报告，样本浓度和文库浓度检测报告；下机原始数据及碱基评估报告；结果分析报告。

b.数据量要求

宏基因组测序，原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。

对符合建库要求的样品，如测序失败，或测序数据量未达标，供应商需提供加测或者重测。对qPCR已判定为阳性的样本，如测序后未获得相应序列信息，亦视为测序失败。

（4）技术指导：供应商应根据采购人要求，到采购人指定地点进行技术支持。

（5）运输：供应商负责样本运输，运输工具需具备冷链运输资质；运输过程中造成的损失、污染相关等问题，后果均由供应商承担。运输费用由供应商承担。

参数性质

序号

技术参数与性能指标

1

由于不能事先确定样本总数，以最终实际完成测序样本数量进行结算，至少需完成300份样本/菌株的测序，每份样本/菌株测序价格不超过180元，以实际测序份数进行结算。

2

样品接收：采购人提供菌株（高致病性菌株提供灭活菌株或核酸），供应商配备专人负责菌株/样品的收集及运输，根据采购人需求实时收取样品，菌株/样品需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。

3

检测设备技术：供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序，能完成双端150bp及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。 

4

数据要求：

PE150（双端测序，单向读长150bp）及以上测序。交付数据包括原始数据（rawdata）和拼接后数据（cleandata），原始数据格式为fastq，原始数据量（碱基数）≥1.5G，Q20高质量数据量（Clean data）≥1G，碱基数据质量值Q30比例≥85%，单碱基错误率低于十万分之一。拼接后数据格式为fasta。拼接后数据Scaffold数量<100个，Contig数量<200个。覆盖度要求碱基类型分布均匀，无GC分离；基因组10×覆盖度≥95%，基因区覆盖度≥98%，平均覆盖深度≥100×。

5

质控要求：

每批样品收到后应立即开始核酸提取、质量检测等相应工作，进行样品浓度检测和核酸样品完整性检测，核酸样品自收到之日起，于3日内提供当批样品质量检测报告（份数按采购人要求提供）。核酸样品质量检测结果：浓度不低于5ng/ul、总量不低于100ng，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样。核酸提取失败的灭活菌株样品，供应商需加测或者重测。

6

质控要求：文库长度250-350bp，对构建好的文库进行质量和产量的检测。

7

每批样品自质量检测合格采购人回复之日起，10个工作日内交付数据。结果（包含原始数据、拼接后数据）遵照生物安全和信息保密相关规定按采购人要求发往指定服务地点。使用方有权要求供应商提供本服务检测过程中的任何相关数据。

如遇样品质量检测合格，测序污染、失败等情况，供应商需立即启动加测，并于20日内交付全部加测样品的数据，如超过20日，则该批次样品不另外收取费用。

8

其他服务要求

（1）供应商需按照《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》相关要求履行服务，保证信息安全，服务商须在投标文件中提供保密承诺函原件加盖供应商公章（格式自拟），承诺函内容应包含下述内容：不可将样本及与样本有关信息透露给第三方及境外组织，保证生物安全。样品检测过程中造成的损失、污染、生物危害相关等问题，后果均由服务商承担。

（2）供应商提供的实验室需提供无任何外资、合资成份及外国员工，并保证今后不接受任何外资、合资加入。以上情况后果均由服务商承担。

（3）供应商根据服务方需求，提供现场技术服务。

（4）运输：服务商负责样本运输，运输工具必须具备冷链运输的资质；运输过程中造成的损失、污染相关等问题，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。（提供承诺函原件加盖供应商公章，格式自拟）。

（5）服务地点：为方便样本运输，供应商检测地点应为国内大中城市